Genotyping en Phenotyping kinne identifisearje, en sels foarstelle, HIV-drugresistance
Sels foar minsken mei in optimale oanbefelling foar therapy, wurdt in soad degree fan HIV-medisynresistinsje ferwachte wurde om te ûntwikkeljen oer de tiid troch gefolch fan natuerlike mutaasjes fan 'e firus. Yn oare gefallen kin wjerstân rapper ûntwikkelje as suboptimal hâlden wurde foar resistente HIV-populaasjes te goaien, liedend úteinlik foar behanneling fan in behanneling.
As behanneling fan behanneling foarkomt, moatte alternatyf drugskombinaasjes selektearre wurde om de nije befolking fan resistint firus te ûnderdrücken.
Genetyske fersetsstests helpe dit troch it fêststellen fan 'e soarten resistente mutaasjes yn' e "virale pool" fan 'e persoan, wylst it bestriden fan hoe saaksber binne dy firiden mooglik antiretrovirale agents .
Twa primêre arkbakken wurde brûkt foar genetyske fersetsstests yn HIV: de HIV-genotypyske assay en de HIV-fenotypyske assay .
Wat is in genotyp en in phenotype?
Troch definikaasje is in genotyp gewoan de genetyske foarm fan in organisme, wylst in fenotype de bemerkbere skaaimerken of traits fan dat orgaan is.
Genotypyske assays (of genotyping) funksjonearje troch it identifisearjen fan de erfenearre ynstruksjes yn 'e genetyske kodearring fan' e sel of DNA. Phenotypyske assays (of phenotyping) befestigje de útdrukking fan dy ynstruksjes ûnder ynfloed fan ferskate omlizzende omstannichheden.
Wylst de feriening tusken genotyp en fenotype net absolút is, kin genotyping faak foar predypyf wêze fan fenotype, benammen as feroaringen yn 'e genetyske koade ferwize nei ferwachte feroaringen yn traits of skaaimerken - lykas by it gefal fan ûntwikkelings fan drugs.
Ferentyping, oan 'e oare kant, befestiget de "hjir-en-no." It befoarderet in reaksje fan in organisme fan reaksje op spesifike feroaringen yn 'e miljeubedruk - lykas by HIV is ferskate medisinen en / of medyske konsintraasjes belutsen.
Untfongen fan genotyping fan HIV
HIV-genotyping is algemien de meast foarkommende technology dy't brûkt wurdt foar fersetsried.
It doel fan 'e assay is om spesifyk genetyske mutaasjes yn' e gagpol- regio fan it virus ' genome (of genetyske koade) te bepalen. Dit is de regio dêr't reverse transkriptase, protease en yntegraasje-enzyme - de doelen fan 'e measte antiretrovirale medisinen - opnommen binne op de DNA-keamer.
Troch it earste amplificearjen fan it HIV-genôch mei it brûken fan polymerase chain reaction (PCR) technyk kinne laboratoaren tekeningen (of "kaart") de genetyske wittenskip brûke troch ferskate mutaasje-detectie-technologyen.
Dûbeld mutaasjes (of accumulation fan mutaasjes) wurde yntellekt troch techniken dy't de relaasje tusken de identifisearre mutaasjes en de firus 'ferwachte gefoeligens oan ferskate antiretrovirale drugs analysearje'. Online-databases kinne assistinsje troch te fergelykjen fan 'e test-folchoarder oan dy fan in prototype ' wildtype '-virus (dat is HIV, dat gjin resistint mutaasjes befettet).
De ynterpretaasje fan dizze tests wurdt brûkt om bestimming fan drugs te bepalen, mei it grutter tal kaaienmutaasjes dy't in hegere nivo fan drugsbestriding oanbean .
Explosjonele HIV-phenotyping
HIV-fenotyping beoardielet it groei fan HIV's persoan yn 'e oanwêzigens fan in medisyn, dan fergeliket dat ta groei fan in kontrôle, wyldtype-virus yn deselde drugs.
Krekt as mei genotypyske assays ferheffen phenotypyske ûndersoarten de gagpolpol fan it HIV-genom.
Dizze seksje fan 'e genetyske koade wurdt dan "graft" op in wildtyp klon mei rekombinante DNA-technology . It resultaat rekombinante virus wurdt brûkt om yn in vitro in sûkelade-sellen te ynfieren (yn it laboratoarium).
De virale probleem wurdt dan ekspresje op hieltyd mear konsintraasjes fan ferskillende antiretrovirale medisinen oant 50% en 90% virale ûnderdrukking is berikt. De konsintraasjes binne dan fergelike mei resultaten fan 'e kontrôle, wyldtypeprobe.
De relatyf "fel" feroaringen jouwe it weardepunt troch hokker drugsaksifikaasje fêststeld wurdt. In fjouwerfâldige wiziging betsjut gewoan dat fjouwer kear de bedrach fan drugs nedich wie om virale ûnderdrukking te fergelykjen yn ferliking mei dy fan 'e wyldtype.
Hoe grutter de falde wearde, de minder susceptibel is de firus in spesifike medikaasje.
Dizze wearden wurde dêrnei binnen in legere klinyske en hegere klinyske farianten pleatst, mei boppesteande wearden dy't oan hegere nivo's fan drugsbestriding ferheven. (Sjoch probleemrapport .)
Wannear is in genetyske fersetsstests útfierd?
Yn 'e Feriene Steaten wurdt genetyske fersetsprobleazens tradisjoneel útfierd op behanneling naïve pasjinten om te bepalen as se in "fertsjinste" medisynresistinsje hawwe. Studies yn 'e Feriene Steaten suggerearje dat tusken 6% en 16% fan oertsjinne firus bestindige wurde op minstens ien antiretrovirale medisinen, wylst sawat 5% behertig wêze mei mear as ien klasse fan drugs.
Genetyske fersetsprotest wurdt ek brûkt as drug-resistinsje wurdt yn petearen yn terapy oansteld. Teste wurdt dien doe't de pasjint it mislearre regime nimt of binnen fjouwer wiken fan behanneling stoppe as de virale lading grutter is as 500 kopyen / ml. Genotypyske toetsen binne meast foarkommen te foarkommen yn dizze eksimplaren as se minder kostje, in flugger turnaround tiid hawwe en in gruttere sensibiliteit oanbiede foar it fekken fan gemiksels fan wyldtype en resistint firus.
In kombinaasje fan phenotypyske en genotypyske toetsen is algemien foarkommen foar persoanen mei komplekse, multy-drugswettichheid, benammen foar dyjingen dy't ekspresje foar protease-ynhibitoren .
Boarne:
Wrâldsûnensorganisaasje (WHO). "Fysiologyske feilichheidskrift". Geneva, Switserlân; 11 april 2011.
Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; en oaren. "Trend yn transmisearre HIV-1 ARV-medisynresistente-assosjearre mutaasjes: 10 HIV-tafoegingsgebieten, US, 2007-2010." 20e Konferinsje oer Retrovirus en Opportunistyske Ynfeksjes. Atlanta, Georgia; 6 maart 2013; Orale abstrakt 149.
National Institutes of Health (NIH). "Richtlinen foar gebrûk fan antiretrovirale aginten yn HIV-1-befeilige folwoeksenen en adolesinten." Bethesda, Marylân; 11 oktober 2013.